Geünificeerde COVID-19 test: Detecteer, volg varianten & co-infecties in één procedure

Een nieuw type COVID-19 teststrategie kan helpen het proces van het identificeren van gevallen, het volgen van varianten, en het detecteren van co-infecterende virussen te stroomlijnen. Op dit moment zijn gescheiden assays en complexe workflows betrokken bij elk van deze drie diagnostische procedures, met analyses typisch uitgevoerd in gespecialiseerde faciliteiten. Onderzoekers hebben nu alle drie soorten tests gecombineerd in een enkele procedure die point-of-care tracking van COVID-19 en de vele opkomende varianten van SARS-CoV-2 mogelijk zou maken.

De test omvat een draagbare, portemonnee-grote mini-laboratorium dat de trage en dure technieken vermijdt die standaard zijn voor COVID-19 screening en monitoring. De test profiteert van een genetische methode (genaamd recombinase polymerase amplificatie) en een draagbare sequencer om snel de aanwezigheid van virale sequenties te detecteren en readouts te leveren in tot 96 patiëntmonsters tegelijk.

De test was ontworpen om vijf segmenten van het SARS-CoV-2 genoom te decoderen, elk gekozen om variant tracking te helpen sturen. De onderzoekers hebben ook assays voor drie veelvoorkomende respiratoire virussen geïncorporeerd die symptomen kunnen veroorzaken die lijken op COVID-19.

Het team valideerde de techniek — genaamd NIRVANA — met neus- en keelkwasten van mensen verdacht van SARS-CoV-2 infecties. Ze testten ook afvalwatermonsters verzameld van gemeentelijke rioolwater om te laten zien hoe de methode populatie-niveau surveillance van SARS-CoV-2 en andere virussen mogelijk zou maken.

Een beperking van de test is dat het alleen SARS-CoV-2 mutaties in geselecteerde genoomregio's kan detecteren en naarmate nieuwe varianten van zorgen wereldwijd blijven opduiken, die regio's misschien geüpdatet moeten worden om de evoluerende aard van het virus weer te geven.