Alles-in-één-test voor COVID-19-bewaking

Een nieuw type COVID-19-teststrategie kan helpen bij het stroomlijnen van het proces van het identificeren van gevallen, het volgen van varianten en het detecteren van co-infectieuze virussen. Momenteel zijn bij elk van deze drie diagnostische procedures afzonderlijke tests en complexe workflows betrokken, waarbij analyses doorgaans worden uitgevoerd in zeer gespecialiseerde faciliteiten. Onderzoekers hebben nu alle drie soorten tests gecombineerd in één procedure die het mogelijk moet maken om COVID-19 en de vele opkomende varianten van SARS-CoV-2 op het punt van zorg te volgen.

De test omvat een draagbaar minilaboratorium ter grootte van een aktetas dat de trage en dure technieken vermijdt die standaard zijn voor COVID-19-screening en -monitoring. De test maakt gebruik van een genetische methode (recombinase-polymerase-amplificatie genaamd) en een draagbare sequencer om snel de aanwezigheid van virale sequenties te detecteren en uitlezingen te geven in maximaal 96 patiëntmonsters tegelijk.

De test is ontworpen om vijf segmenten van het SARS-CoV-2-genoom te decoderen, elk gekozen om het volgen van varianten te helpen begeleiden. De onderzoekers namen ook tests op voor drie veel voorkomende respiratoire virussen die symptomen kunnen veroorzaken die vergelijkbaar zijn met COVID-19.

Het team valideerde de techniek - NIRVANA genaamd - met behulp van neus- en keeluitstrijkjes van mensen die verdacht werden van SARS-CoV-2-infecties. Ze testten ook afvalwatermonsters die waren verzameld uit gemeentelijk rioolwater om te laten zien hoe de methode bewaking op populatieniveau van SARS-CoV-2 en andere virussen mogelijk zou maken.

Een beperking van de test is dat deze alleen SARS-CoV-2-mutaties kan detecteren in geselecteerde genomische regio's en aangezien er overal ter wereld nieuwe zorgwekkende varianten opduiken, moeten die regio's mogelijk worden bijgewerkt om de evoluerende aard van het virus te weerspiegelen.