Hergebruik veilige medicijnen met BIOVIA Living Map

Nieuwe richtingen in de strijd tegen COVID-19

Herbestemming van geneesmiddelen en systeembiologie kunnen helpen bij het identificeren van geneesmiddelen waarvan bekend is dat ze veilig en effectief zijn voor de behandeling van het SARS-CoV-2-virus. Gelukkig kunnen deze dubbele benaderingen ook de weg wijzen naar behandelingen voor toekomstige pathogene coronavirussen.

Veilige medicijnen hergebruiken  in een wereldwijde pandemie

Herbestemming van geneesmiddelen omvat het onderzoek van bestaande, klinisch geteste en veilige geneesmiddelen voor nieuwe therapeutische doeleinden.

Wetenschappers gebruiken structuurgebaseerde en virtuele screening om bestaande medicijnen te selecteren op basis van hun in silico neiging om zich op virale protease te richten en mogelijk de virusproliferatie te verminderen. Zie Pharmacophore-geleide virtuele screening voor hergebruik van geneesmiddelen en Remming van SARS-CoV-2 belangrijkste protease . Geen enkel bekend medicijn is echter echt opgevallen. Daarom moeten we andere strategieën overwegen.

Systeembiologie richt zich op de computationele analyse en modellering van complexe interacties binnen biologische systemen. Bovendien maakt deze aanpak gebruik van de enorme hoeveelheid gegevens en kennis die wereldwijd is vergaard door vele COVID-19-initiatieven.

Navigeren in systeembiologie met een levende kaart

BIOVIA Living Map is een service op de Dassault Systèmes 3D ERVARING ^® platform. Het biedt krachtige modellerings- en simulatiemogelijkheden voor systeembiologie. Belangrijk is dat het ook de toegang tot academische gegevensbronnen en kennis automatiseert.

Met Living Map kunnen biologen Booleaanse biologische netwerken ontwerpen en simuleren. Bovendien stellen de wetenschappelijk gevalideerde Booleaanse signaalroutes van de app wetenschappers in staat om kwalitatieve ziektekaarten te maken, die in silico worden ontworpen. experimenten en test nieuwe hypothesen.

Bovenal kunnen wetenschappers een Living Map-model annoteren met bewijsondersteunende links naar referentiedatabases. Ze kunnen entiteiten, interacties en redenen voor modellering annoteren. Belangrijk is dat deze kritische, bewijskrachtige annotaties het betrouwbaarheidsniveau van BIOVIA Living Map voortdurend verhogen.

Het modelleren van SARS-CoV-2-effecten op aangeboren immuniteit

Wetenschappers van BIOVIA gebruiken Living Map om de herbestemming van medicijnen in de strijd tegen SARS-CoV-2 te onderzoeken.

In één project hebben we een dynamisch model geconstrueerd door generieke signaalroutes voor coronaviruscellen samen te stellen die vóór COVID-19 waren gepubliceerd. Vervolgens hebben we ons model aangepast en gevalideerd met meer specifieke en recente SARS-CoV-2-kennis. Ten slotte lanceerden we simulaties om kandidaat-geneesmiddelen te onderzoeken voor herbestemming en om nieuwe therapeutische interventies voor te stellen. Vervolgens voorspelde Living Map geen goedgekeurd medicijn om het coronavirus om te keren. De toepassing identificeerde echter wel een interactie tussen virus en gastheereiwit die mogelijk effectief zou kunnen zijn.

Een niet-coronavirusinfectie simuleren versus SARS-CoV-2

Deze video laat zien hoe we een klassieke, niet-coronavirusinfectie hebben gesimuleerd en getest. Toen we de klassieke infectie simuleerden, ontdekten we dat de aangeboren immuunrespons van de gastheer met succes de replicatie/vermeerdering van de infectie remde.

Toen we echter het SARS-CoV-2-virus testten, ontdekten we dat het coronavirus de aangeboren immuunrespons van de gastheer remde. Hierdoor kon het coronavirus zich vervolgens met succes repliceren en verspreiden. In overeenstemming met de klinische waarnemingen verhoogde het SARS-CoV-2-virus de productie van pro-inflammatoire cytokines. Dit resulteerde in een cytokinestorm waarin het lichaam zijn eigen cellen en weefsels aanvalt in plaats van het virus te bestrijden.

Vooruitgang in innovatieve doeldetectie

Geleid door BIOVIA Living Map, kunt u samenwerken, begrijpen en annoteren van ziektemechanismen, het werkingsmechanisme van geneesmiddelen en resistentie tegen behandeling op de 3D ERVARING ^® platform. U kunt modellen bouwen en gebruiken om R&D-hypothesen te onderzoeken door middel van simulatie. Bovendien kunt u het ontdekken van innovatieve doelen bevorderen en tegelijkertijd de meest veelbelovende therapeutische scenario's uitzoeken.

BIOVIA Living Map kan helpen om de tijd voor wetenschappelijk onderzoek met weken te verkorten. Bovendien kan het de validatiekosten van natte laboratoria verlagen en de kans op succesvolle ontdekking vergroten.

Zeker, als je op ontdekkingsreis gaat, heb je een goede kaart nodig om je te begeleiden.

Hergebruik veilige medicijnen met BIOVIA Living Map!